2021年1月15日，按照国家民委“中华民族共同体研究基地”管理办法，经内蒙古师范大学校党委会议通过，决定在民族学人类学学院设置独立的“中华民族共同体研究基地”科研及管理机构，并确保配备10名研究人员编制。

基地主任由内蒙古师范大学党委书记、校长李树林教授担任，副主任由民族学人类学学院乌日陶克套胡院长/教授担任。基地首席专家聘请长江学者、内蒙古师范大学纳日碧力戈教授担任。

基地下设办公室，办公室设在民族学人类学学院，主任由乌日陶克套胡教授兼任。

根据基地建设和科学研究的需要，由呼和浩特市委统战部牵头，2021年6月17日内蒙古师范大学与呼和浩特市职业学院合作建立了“中华民族共同体研究基地呼和浩特分基地”。